醫院污水來源及成分復雜，含病原性微生物、有毒、有害的物理化學污染物和放射性污染等，具有空間污染、急性傳染和潛伏性傳染等特征，不經有效處理會成為一條疫病擴散的重要途徑和嚴重污染環境。
醫院污水處理設備可以處理以下來源的污水：
1.醫院污水受到糞便、傳染性細菌和病毒等病原性微生物污染，具有傳染性，可以誘發疾病或造成傷害。
2.醫院污水中含有酸、堿、懸浮固體、BOD、COD和動植物油等有毒、有害物質。
3.牙科治療、洗印和化驗等過程產生污水含有重金屬、消毒劑、有機溶劑等，部分具有致癌、致畸或致突變性，危害人體健康并對環境有長遠影響。
4.同位素治療和診斷產生放射性污水。放射性同位素在衰變過程中產生a-、β-和γ-放射性，在人體內積累而危害人體健康。
醫院污水處理設備處理原則：
1.全過程控制原則：對醫院污水產生、處理、排放的全過程進行控制。
2.減量化原則：嚴格醫院內部衛生安全管理體系，在污水和污物發生源處進行嚴格控制和分離，醫院內生活污水與病區污水分別收集，即源頭控制、清污分流。嚴禁將醫院的污水和污物隨意棄置排入下水道。
3.就地處理原則：為防止醫院污水輸送過程中的污染與危害，在醫院必須就地處理。
4.分類指導原則：根據醫院性質、規模、污水排放去向和地區差異對醫院污水處理進行分類指導。
5.達標與風險控制相結合原則：全面考慮綜合性醫院和傳染病醫院污水達標排放的基本要求，同時加強風險控制意識，從工藝技術、工程建設和監督管理等方面提高應對突發性事件的能力。
6.生態安全原則：醫院污水處理設備可有效去除污水中有毒有害物質，減少處理過程中消毒副產物產生和控制出水中過高余氯，保護生態環境安全。
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